题目:CombinatorialinteractionsoftheLEC1transcriptionfactorspecifydiversedevelopmentalprogramsduringsoybeanseeddevelopment
通讯作者:JohnJ.Harada
第一作者:LeonardoJo
第一单位:加州大学戴维斯分校植物生物学系
影响因子(IF=):10.62
内容简介:
LEC1是种子发育的中心转录调节因子,因为它在不同阶段调节不同的发育过程,包括胚胎形态发生、光合作用、激素生物合成和信号传导,以及种子储存大分子的大量积累。
为了了解LEC1如何在发育过程中调节不同的基因集,我们探讨了LEC1与其他转录因子联合作用的可能性。我们的结果表明,LEC1与种子转录因子(TFs)、AREB3、BZIP67和ABI3联合作用,并且不同的TF组合调节不同的基因集。我们进一步表明,TF结合位点在基因组中紧密聚集,并包含由TFs结合的丰富的DNA序列基序,不同的DNA基序集招募不同的TF组合来结合位点簇。我们的发现为控制种子发育的基因调控网络提供了见解。
主要结果:
1、大豆胚胎发育中AREB3、BZIP67和ABI3靶基因的鉴定
1、IdentificationofAREB3,bZIP67,andABI3TargetGenesinDevelopingSoybeanEmbryos
2、LEC1与AREB3、bZIP67和ABI3结合作用,调节大豆胚胎不同发育过程的基因的表达
2、LEC1OperatesinCombinationwithAREB3,bZIP67,andABI3toRegulatetheExpressionofGenesInvolvedinDistinctDevelopmentalProcessesinSoybeanEmbryos
3、LEC1、AREB3、bZIP67和ABI3结合位点被聚集,并包含不同的DNA序列元件
3、LEC1,AREB3,bZIP67,andABI3BindingSitesAreClusteredandContainDistinctSetsofDNASequenceMotifs
4、结合位点聚类是功能顺式调节模块
4、BindingSiteClustersAreFunctionalcis-RegulatoryModules
文章主图:
图1大豆早期成熟胚胎中LEC1、AREB3、BZIP67和ABI3靶基因的鉴定。
图2LEC1、AREB3、bZIP67和ABI3靶基因之间的重叠表明了转录因子之间的组合相互作用
图3LEC1、AREB3、bZIP67和ABI3的聚类结合位点界定了调节模块。
图4大豆胚胎子叶细胞中顺式调控模块和顺式元件的功能分析
机制图:
图5大豆种子发育控制中LEC1与AREB3、ABIP67、ABI3的组合相互作用模型
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