虽然大多数宝石都是矿物材料，但也有一部分有机材料被划归为宝石家族。最常见的是珍珠、动物骨骼、琥珀、珊瑚、煤精和象牙。这些材料是由生物体产生的，然后被切割成宝石和其它装饰物。
还有些有机材料已经矿化（被玉髓、蛋白石、方解石、文石、*铁矿或其他矿物材料取代和填充）。虽然它们本身已经不是有机物，但仍然保存着有机结构，例如木化石、珊瑚化石、恐龙骨化石以及其他生物体或器官的化石。（资料来源：geology.